本廠隸屬於臺北市政府環境保護局,為該局所屬機關,置廠長、副廠長、秘書及正工程司各1人,下設3組4室,預算員額147人,組織架構圖如下:
廠本部包含廠長、副廠長、秘書及正工程司共4人。 本廠各單位職掌(預算員額數)如下: